Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc36Q6PDM4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc36Q6PDM4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms