Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pkp4Q68FH0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkp4Q68FH0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms