Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rbm38Q62176 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rbm38Q62176 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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