Protein–RNA interactions for Protein: Q62158

Trim27, Zinc finger protein RFP, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim27Q62158 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim27Q62158 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trim27Q62158 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms