Protein–RNA interactions for Protein: Q61738

Itga7, Integrin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga7Q61738 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Itga7Q61738 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga7Q61738 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms