Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ccne1Q61457 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccne1Q61457 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccne1Q61457 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms