Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ift20Q61025 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ift20Q61025 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms