Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
DbpQ60925 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
DbpQ60925 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
DbpQ60925 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms