Protein–RNA interactions for Protein: Q60770

Stxbp3, Syntaxin-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp3Q60770 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Stxbp3Q60770 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Stxbp3Q60770 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms