Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD5

Vmn1r196, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r196Q5SVD5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r196Q5SVD5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r196Q5SVD5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms