Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TefmQ5SSK3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TefmQ5SSK3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms