Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rtp3Q5QGU6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms