Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0K5

4930567H17Rik, RIKEN cDNA 4930567H17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930567H17RikQ3V0K5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
4930567H17RikQ3V0K5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930567H17RikQ3V0K5 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930567H17RikQ3V0K5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms