Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Garnl3Q3V0G7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Garnl3Q3V0G7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms