Protein–RNA interactions for Protein: Q3V016

Hipk4, Homeodomain-interacting protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk4Q3V016 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hipk4Q3V016 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk4Q3V016 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk4Q3V016 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk4Q3V016 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hipk4Q3V016 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk4Q3V016 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk4Q3V016 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk4Q3V016 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hipk4Q3V016 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms