Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJP5

Protein C8orf37 homolog, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJP5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Q3UJP5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UJP5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UJP5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Q3UJP5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms