Protein–RNA interactions for Protein: Q3UB74

Tbrg1, Transforming growth factor beta regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbrg1Q3UB74 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tbrg1Q3UB74 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tbrg1Q3UB74 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms