Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3S3

Cenpl, Centromere protein L, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenplQ3U3S3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CenplQ3U3S3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CenplQ3U3S3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms