Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVI8

Pbxip1, Pre-B-cell leukemia transcription factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbxip1Q3TVI8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pbxip1Q3TVI8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pbxip1Q3TVI8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms