Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tamm41Q3TUH1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tamm41Q3TUH1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms