Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xlr4cQ3TKR2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xlr4cQ3TKR2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms