Protein–RNA interactions for Protein: Q2QI47

Ush2A, Usherin, mousemouse

Predictions only

Length 5,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush2AQ2QI47 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ush2AQ2QI47 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms