Protein–RNA interactions for Protein: Q0PD08

Rab42, Ras-related protein Rab-42, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab42Q0PD08 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rab42Q0PD08 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.6 ms