Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ssrp1Q08943 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ssrp1Q08943 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms