Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tff1Q08423 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tff1Q08423 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tff1Q08423 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tff1Q08423 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff1Q08423 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff1Q08423 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff1Q08423 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tff1Q08423 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tff1Q08423 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tff1Q08423 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms