Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gata4Q08369 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gata4Q08369 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms