Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cnn2Q08093 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cnn2Q08093 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms