Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
F13bQ07968 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
F13bQ07968 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms