Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prrx2Q06348 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrx2Q06348 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms