Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
F8a1Q00558 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
F8a1Q00558 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms