Protein–RNA interactions for Protein: P81269

Atf1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf1P81269 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf1P81269 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Atf1P81269 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf1P81269 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atf1P81269 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atf1P81269 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms