Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Irx3P81067 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Irx3P81067 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms