Protein–RNA interactions for Protein: P80315

Cct4, T-complex protein 1 subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct4P80315 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cct4P80315 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cct4P80315 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Cct4P80315 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cct4P80315 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms