Protein–RNA interactions for Protein: P68181

Prkacb, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkacbP68181 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
PrkacbP68181 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PrkacbP68181 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms