Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab1AP62821 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab1AP62821 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rab1AP62821 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab1AP62821 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms