Protein–RNA interactions for Protein: P61089

Ube2n, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2nP61089 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ube2nP61089 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ube2nP61089 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms