Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ube2kP61087 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2kP61087 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms