Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ppfia3P60469 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ppfia3P60469 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms