Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nphp4P59240 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nphp4P59240 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nphp4P59240 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms