Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdrg1P59048 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Pdrg1P59048 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms