Protein–RNA interactions for Protein: P59016

Vps33b, Vacuolar protein sorting-associated protein 33B, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33bP59016 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps33bP59016 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vps33bP59016 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vps33bP59016 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms