Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rhbdl3P58873 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rhbdl3P58873 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms