Protein–RNA interactions for Protein: P56546

Ctbp2, C-terminal-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctbp2P56546 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ctbp2P56546 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ctbp2P56546 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms