Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Usp5P56399 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp5P56399 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms