Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pold1P52431 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms