Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa6P50704 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa6P50704 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Defa6P50704 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms