Protein–RNA interactions for Protein: P50592

Tnfsf10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf10P50592 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfsf10P50592 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms