Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cxcl5P50228 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cxcl5P50228 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms