Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rfx2P48379 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rfx2P48379 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms