Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl11P48298 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl11P48298 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms